Fusarium oxysporum v ochraně rostlin proti háďátkům

Ta poskytuje v některých pěstitelských systémech biologickou alternativu ochrany k syntetickým nematocidům. Ne všechny nepatogenní izoláty F. oxysporum jsou však jako endofyti schopné tuto systémovou obrannou reakci rostlin v dostatečné míře vyvolat. Proto jsou výzkumy University Bonn zaměřeny na identifikaci vhodných, nepatogenních izolátů F. oxysporum různého geografického původu z hlediska jejich využitelnosti v biologické ochraně proti fytoparazitickým háďátkům na různých kulturních rostlinách. Za tímto účelem jsou analyzovány sekvence určitých úseků genomu a podle SNPs (Single Nucleotide Polymorphismus) vyvíjeny specifické primery, pomocí nichž by se měl zredukovat počet izolátů k testování ve skleníkových pokusech. Ačkoli bylo prokázáno, že houba vyvolává obrannou reakci rostlin, nemohl být přesný mechanismus této souhry ještě zcela objasněn. Proto by měla být pomocí molekulárních metod získána charakteristika mechanismu systémové rezistence rostlin, a to tak, že budou simulovány různé situace napadení: kolonizace rostlin pouze háďátky, kolonizace pouze endofyty nebo kolonizace oběma organismy. S cílem zjistit, jestli klíčovou roli při obranných reakcích rostlin hraje indukovaná systémová rezistence (ISR) nebo systémově získaná rezistence (SAR), jsou in planta zjišťovány a kvantifikovány obranné PR proteiny a je sledována aktivace transkripčního faktoru NPR1 (nonexpressor of PR genes1). Získané výsledky by měly být využity k optimalizaci biologické ochrany proti fytoparazitickým háďátkům.